1998年吴伟在浙江绿城开始职业足球生涯，2006赛季帮助球队冲超成功。

2009年被杭州绿城俱乐部挂牌，在没有球队引进的情况下前往宁波大学学习，2010年重返绿城。

2012年2月加盟贵州人和。

2014年1月以自由身回归杭州绿城。

场上司职中卫，2007赛季中超联赛中曾被当做中锋使用，并打进2球。