蒿俊闵小学毕业后进入武汉市足球学校接受训练。2001年由于足校濒临解散，蒿俊闵在时任中国国少队主帅刘春明的力荐下加盟天津泰达，继续职业生涯。

蒿俊闵在2003年进入天津泰达一队，并逐渐成长为球队主力。

2011年7月8日，沙尔克04官方宣布，中国球员蒿俊闵正式与俱乐部解约离开球队，回国加盟中超球队山东鲁能，签约3年。

随国家队参加2011卡塔尔亚洲杯，小组赛前2场均是替补出战，最后一场与乌兹别克斯坦的比赛中首发出战并打进一记精彩任意球。

蒿俊闵参加了2002年亚少赛和2003年世少赛。2004年进入中国国青队，并在2005年荷兰世青赛上有出色表现，并以主力身份代表中国国奥队参加了2008年北京奥运会的足球比赛。

2010年2月1日加盟德国甲级联赛沙尔克04队。2月11日，他在德国杯1/4决赛沙尔克04客场1比0击败奥斯纳布吕克的比赛中替补出场，第一次代表沙尔克04亮相。

2005年8月3日，在东亚四强赛中国队2:2战平日本队的比赛中，蒿俊闵替补出场上演国家队首秀。

2008年2月23日，在东亚四强赛中国队3:1击败朝鲜队的比赛中，蒿俊闵打进在国家队的首粒进球。

2015赛季，蒿俊闵以1365次传球排名中超传球榜第5

2015赛季，蒿俊闵以9次助攻排名中超助攻榜第3

2010年2月21日，蒿俊闵第一次代表沙尔克04在德甲比赛中登场。

蒿俊闵在效力沙尔克04一年半时里代表球队在正式比赛中出战19次（14场联赛，3场德国杯以及2场欧冠）。

2005年获得中超联赛最佳新人奖，2007年再次获得中超联赛最佳新人奖。2008年帮助球队获得联赛第四名，赢得2009年亚冠比赛资格。